(一)实行收入预算管理
单位应根据上年度实际收入水平，结合当年的业务计划及医疗收费标准调整情况来确定收入总额。
为了促进收入预算顺利实现，单位应每季开展预算执行情况分析，考核、评价收入预算的执行情况，分析完成好坏的原因，发现薄弱环节和问题，提出改进措施和意见，保证全年总收入预算的顺利完成，并为编制和执行下年度预算提供依据。
(二)严格执行国家规定的收费标准和加强收费票据的管理
乡镇卫生院的各项收费要认真执行国家的物价政策，做到“应收则收，应收不漏”，但任何部门和个人不得发生巧立名目、分解项目、重复收费等乱收费行为。单位应根据实际情况配设专职(或兼职)物价员，及时检查和收集收费情况，保证收入的合法性、完整性。
收费票据分为财政部门统一监制的票据和自制票据。乡镇卫生院的门诊、住院等收费必须使用财政部门统一监制的收费票据;单位内部管理需要可使用自制或外购收款票据。所有收费票据和自制收款票据须由单位财务部门统一管理，由专人负责，实行领用核销制度。不得出借、出让收费票据，行政事业性收款收据不得用于经营性收费。
(三)单位的全部收入纳入财务部门统一核算和管理。
卫生院的收费部门主要由财务科、挂号室、门诊收费处和住院结算处组成，开展的业务收费由挂号室、门诊收费处、住院收费处负责，其他各种收费由财务科统一办理，其他任何部门和个人都不得向病人或单位直接收取任何费用。
挂号、门诊及住院收费处应将每日收到的现金及支票于当天存入银行，或及时上交出纳人员，同时编制“收费日报表”，并将“收费日报表”及附件(收支票据存根联等)送交财务部门，出纳应根据收入凭证及时入账，并在凭证上加盖“现金收讫”章。
严禁业务科室截留收入，严禁私设小金库。卫生院也不得将收入转到三产、工会、食堂等部门。
(四)加强对医院收入的控制
卫生院应设专职或兼职稽核、审计人员，加强对各收费部门报来的收入凭证和存根的审核，如是否少收或多收、日报表金额是否与所附存根金额合计数一致、是否足额交库等;药品收入应注意是否与药房处方合计数一致;是否严格使用财政部门统一监制的收费票据，有无使用其他票据而使资金出现外流等现象。
